日本别科是指设立在大学内的特别学习科，可以理解为大学内的专门针对外国人的日本语学习科。进入别科的学生和日本学生一起在大学校园内共同学习、生活，可以更深入的了解日本文化。全部设立在私立大学之中。
日本语言学校是学习日本语的独立教育机构。日本语言学校分阶段教授学生日本语，同时进行系统的升学指导。
虽然日本别科学校也是留学签证，但是只有一年课程（语言学校通常为两年）。也就是说，如果学生没有日本语基础，一年内又无法达到日本语二级以上水平，很难升学，将面临很尴尬的归国问题。有些地方承诺，别科毕业后都可以升入本学校，纯属虚构。升学还是要有基础日本语水平的，通常学部需要日本语能力二级水平，大学院需要一级水平，而不是进了别科就进了保险箱。所以没有一定的日本语基础，不要选择别科。
日本别科学校只有私立大学开设，国公立大学没有。私立大学的学历虽然在国际上和在中国均被承认，但是学费昂贵，学历含金量、国际排名往往与国公立大学无法媲美。所以学习成绩优异的学生，一般不建议进入私立大学别科。